祭神は神功皇后、仲哀天皇、応神天皇など九柱を祀る。
８６２年、境内から清泉が湧き出て、その香気が漂い、その水を飲むとたちまち病が癒えたので、「御香宮」を賜った。
以後、伏見の産土神として人々の信仰を集めたが、度々の兵乱や天災により荒廃した。
１５９２年～９６年、豊臣秀吉は、当社を伏見城内に移し、鬼門の守護神としたが、１６０５年、徳川家康により旧地である当地に戻され、現在の本殿（重文）が建立された。
表門（重文）は、旧伏見城の大手門と伝えられている。
宝物として、秀吉の寄進した金熨斗付太刀（きんのしつけたち）（重文）を蔵する。
毎年、１０月の神幸祭は、伏見祭・花傘祭とも呼ばれ、神輿や花傘、獅子などが出て、盛大に行われる。
鳥羽伏見の戦いでは薩摩藩の屯所となった。
京阪電車 伏見桃山駅から徒歩5分ほどの駅前近くにある神社。
境内
脇には今でも伏見城の城郭をなしていた石の廃材が転がっている。
極彩色豊かな障壁画が天井を彩る。
拝殿
名水百選にも選ばれている「御香水」。
